在上海亲子鉴定取和送检物证的污染含有DNA的生物组织和体液在离开生物体后，就可能被其他物质污染，从而影响DNA的分析结果。常见上海亲子鉴定的污染物有三种，非生物物质、非人的生物物质和他人的DNA。非生物物质的污染是最常见的，主要是染料、洗涤剂、灰尘和各种生产生活中包括一些化学物质在内的非生物物质。其中有些污染物在物证斑迹形成前就存在于形成斑迹的载体上了。如布的染料、衣服上残存的洗涤剂。不同的污染物对DNA的分析影响不同，有的影响重，如深色布载体上的染料就能抑制DNA内切酶和DNA聚合酶的活性，.非人的生物物质污染包括各种动植物和微生物等。虽然法上海亲子鉴定医学选择应用的DNA遗传标记一般是人特异的，能区分开人与动物，一般不影响最后结果的解释，但也应注意防止这类物质的污染。一些动物DNA偶尔在人的DNA分析中也出现交叉反应。在进行DNA检验前，应进行种属检验。微生物的污染则影响比较大，需要特别予以注意。现场的血液斑、精液斑是细菌和真菌的良好培养基，这些微生物分泌的物质如核酸酶等能降解其中的DNA使DNA 的分型难以获得结果。

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